In THE TREE OF LIFE groeit de 11-jarige Jack op met zijn twee broers. Tijdens zijn jonge kinderjaren beleeft Jack de wereld zoals zijn moeder (Jessica Chastain) deze ziet. Zij is de verpersoonlijking van liefde en vergevingsgezindheid en wil hem beschermen tegen kwaad en onrecht. Zijn vader (Brad Pitt) probeert daarentegen zijn zoon klaar te stomen voor de ‘harde buitenwereld’ door hem te leren zichzelf altijd voorop te stellen. Jack probeert hun ideologieën te verenigen in zijn eigen kijk op het leven. Zijn wereldbeeld verslechtert als hij in aanraking komt met de dood. Het leven verandert langzaam van een magische gegeven in een duister labyrint.

Inmiddels volwassen probeert Jack (Sean Penn) dat ene constante in het leven te vinden, terwijl alles om hem heen verandert; het oneindige plan waar wij allemaal deel van uitmaken.

Uiteindelijk realiseert hij zich wat ervoor nodig was om onze wereld te maken: een prachtig, ongeëvenaard wonder.