Dave en zijn zoontje Finny (8) zijn Nestertjes, een vreemd dierenras dat nergens goed voor schijnt te zijn. Als Dave van Finny hoort dat de aarde binnenkort onder water komt te staan en alle dieren samen moeten komen voor een grote reddingsoperatie, moet hij daar flink om lachen. Maar het lachen vergaat hem snel wanneer blijkt dat de overstroming er daadwerkelijk aankomt.
Met de hulp van de carnivoren Hazel en haar dochter Leah weten Dave en Finny op de ark te komen die alle dieren moet redden. Maar wanneer deze op het punt staat te vertrekken, vallen Finny en Leah van boord. De kinderen zijn nu alleen en het gevecht om te overleven begint. Het onwaarschijnlijke duo begint een avontuurlijke tocht vol uitdagingen en verrassingen om zich te redden van het wassende water.